Львів здавна мав славу одного з центрів органної музики. Вперше про орган у Львові згадується у 1409 році, коли цей інструмент встановлювали у Кафедральному соборі. На початку XX ст. у Львові було близько 50 органів роботи відомих німецьких, чеських та місцевих майстрів. Зараз залишилось менше десяти діючих органів та стільки ж напівзруйнованих.
З 1984 року у музеї розпочато унікальну роботу з повернення до життя старовинних органів. За цей час органіст і органний майстер Віталій Півнов відреставрував багато рідкісних інструментів.
В музеї діє музично-просвітницький відділ, який проводить органні концерти, знайомить з історією органної музики. В концертах звучить автентичний бароковий орган кінця XVII століття роботи німецького майстра Людвіга Фогеля. Це єдиний такого типу інструмент в концертній практиці в Україні.
Незабутні враження залишаються після виступів Ірини Маковецької, заслуженої артистки України (вокал), Юрія Остюка (труба), Олени Мацелюх та Віталія Півнова (орган). У програмі звучать твори Й.-С.Баха, Т. Альбініоні, Ф.-П. Шуберта, Ж. Бізе, Дж. Каччіні, а також сучасна музика.
Концерти відбуваються: